《植物生理学报》 2020, 56(2): 327-335

越南参变种实时荧光定量PCR内参基因的筛选和验证

朱灵英, 王一博, 王宝婕, 周青青, 曾礼芳, 徐福荣*, 马晓惠*

云南中医药大学中药学院, 昆明650500

通信作者：徐福荣

摘　要：

实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术被广泛用于基因表达分析, 筛选适宜的内参基因是运用这项技术的前提。本研究采用qRT-PCR筛选适用于越南参变种(Panax vietnamensis var. fuscidiscus)不同组织器官(根、根茎、茎和叶)的内参基因。基于越南参变种转录组数据, 筛选出13个候选基因(ACT1、 ACT2、 bTUB1、 bTUB2、aTUB、 GADPH、 UBQ、 elF、 EF-1a、 F-box、 CYP、 QCR、 TCTP)。利用qRT-PCR技术检测候选内参基因在越南参变种四个组织部位中的表达情况, 并用geNorm、 NormFinder和BestKeeper综合分析候选基因的表达稳定性, 发现ACT1和aTUB在越南参变种不同组织部位中表达稳定性最好。用内参基因ACT1和aTUB分析PvfDS在越南参变种不同组织部位的表达, 发现二者表达规律一致。结果表明, 越南参变种不同组织部位适宜的内参基因为ACT1和aTUB。

关键词：越南参变种; 内参基因; 实时荧光定量PCR